Secuenciamiento aleatorio
Es una estrategia que se emplea para decodificar genomas de organismos. Consiste en generar múltiples fragmentos pequeños de ADN que luego son clonados en vectores y secuenciados. Seguidamente, se emplean computadores para encontrar homologías entre las secuencias generadas por superposición y luego éstas son ordenadas con base en algoritmos definidos, generando fragmentos de mayor tamaño. De esta manera, no es necesario al menos teóricamente emplear mapas físicos que permitan hacer el ordenamiento secuencial de los fragmentos hasta completar de nuevo el genoma que se está estudiando.
La técnica de corte aleatorio se basa en cortar el ADN genómico usando métodos físicos tales como ondas de ultrasonido. Es una manera de cortar el ADN mecánicamente. Esto brinda dos ventajas importantes. Primero, todos los fragmentos tienen tamaños similares y segundo, el tamaño de los fragmentos puede ser regulado por la intensidad de las ondas que se aplican a la muestra. Es como ensamblar un rompecabezas con piezas más pequeñas para obtener una mejor resolución. Los fragmentos son clonados y secuenciados automáticamente. Esta técnica no es nueva, pero se hizo muy conocida cuando se uso para secuencia del genoma de varios organismos, como las bacterias, la levadura, la mosca de la fruta y hasta el ser humano.
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